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一、病毒定義

1. 試定義並比較病毒(virus)和類病毒(viroid)。(6分台大105)
2. 試解釋virus、viroid與prion。(6分台大100)
3. 何謂viroid?試繪圖說明其複製方式。(8分台大98)

二、病毒型態

1. 一個T=3的二十面體對稱的病毒共有多少個鞘蛋白subunit?多少個pentamer?多少個hexamer?(3分中興100)
2. 若有一種T=4的二十面體對稱的病毒，該病毒共有多少個鞘蛋白subunit?多少個pentamer?多少個hexamer?(6分台大98)
3. 球形病毒最常見由多少個鞘蛋白單體(subunit)組成?其排列對稱方式為何?(4分台大102)
4. 何謂內含體(inclusion body)?哪一科的植物病毒會在寄主細胞內產生風車狀內含體?(5分台大107)
5. 植物病毒有脂質包膜(lipid envelope)者，試列出兩屬(genus)，並說明其病毒基因體RNA之特性。(6分台大104)

三、病毒核酸

1. 根據病毒核酸特性可分成哪五種類型?(5分台大107)
2. Most plant viruses contain a (+)ssRNA genome, explain the different strategies they use to exprsss their genes. (10分中興107)
3. 請各舉出一個植物病毒屬名，其核酸特性分別為dsDNA, ssDNA, (+)ssRNA, (-)ssRNA, dsRNA，並請說明其顆粒型態及傳播特性。(15分中興106)
4. 2.請各寫出一個植物病毒屬名其核酸特性分別為dsDNA, ssDNA, dsRNA, (+)ssRNA, (-)ssRNA。(5分中興105)
5. 若分別純化ssRNA(+)和ssRNA(-)病毒顆粒，從中萃取病毒RNA，各自接種至合適寄主植物，請預測兩者接種是否會成功並說明其中原因。(6分台大106)
6. 將ssRNA(+)和ssRNA(-)病毒的RNA分別純化，然後各自接種至合適寄主植物，結果會有何不同?請說明原因。(6分台大101)
7. 根據目前ICTV病毒分類系統，寫出單股DNA植物病毒的科名，並說明其複製之方式。(7分台大106)
8. 根據目前之分類系統，雙股DNA植物病毒屬於那一科?試舉例並繪圖說明該病毒之複製方式。(7分台大99)
9. 試舉例說明三種病毒基因表達(gene expression)的策略。(6分台大106)
10. 請各舉一例說明病毒基因表現的調控點是位於轉錄階段(transcription level)，轉譯階段(translation level)以及後轉譯階段(post-translation level)。(6分台大103)
11. 請說明那些植物病毒在細胞核內複製子代核酸?並繪圖說明其病毒之複製方式。(8分台大104)
12. 病毒可以使用多種方法調控其基因表現，請舉出兩種基因表現的調控是位於轉錄階段(transcription level)，另兩種是位於轉譯階段(translation level)，同時對調控方式加以說明。(10分台大99)

四、病毒變異

1. 新種植物病毒產生的機制(3分中興107)
2. 試述何謂gene silencing suppressor，並舉例說明其作用機制。(6分中興101)
3. 試說明具感染力的cDNA clone的發明對研究植物病毒有何重要性。(5分台大102)
4. 如何區別viroid、defective RNA和satellite RNA?(6分中興105)
5. 試說明並比較衛星病毒(satellite virus)、衛星核酸(satellite RNA)與缺失性RNA(defective RNA)。(7分台大103)

五、病毒檢測

1. 植物病毒的檢測技術，是基於哪些病毒的特性而建立的?檢測病毒和viroids的方法有何相同與相異之處? (3分中興107)
2. 請舉一例說明檢測植物病毒常用的方法與其原理。(6分台大105)
3. 請分別說明PCR和LAMP(Loop-mediated isothermal amplification)技術之原理及其在植物病毒檢測使用上之優點。(10分中興106)
4. 請比較ELISA和RT-PCR偵測的目標為何?應用於檢測植物病毒各有何優缺點?(6分台大107)
5. 請比較direct ELISA和indirect ELISA的優缺點。(5分台大104)
6. 繪圖說明膠金標誌抗體試劑(或稱免疫檢測試紙, Immunostrip)之反應原理，並說明其應用於植物病毒檢測時的優點。(8分中興105七)
7. 請說明如何利用extinction coefficient測量經高度純化之病毒溶液中病毒的濃度。(4分台大102)
8. 若想了解病毒在葉片的分布情形，可採用那些檢測方法?請說明理由(5分台大101)
9. 若有兩種型態相似但不同屬的病毒，可以利用那些方法區分他們?(6分台大100)

六、病毒純化與保存

1. 試說明density gradient centrifugation和local lesion assay的發明對植物病毒的研究有何重要性。(8分台大101)
2. 舉例並說明植物病毒短期保存方法一種與長期保存方法兩種。(3分中興103)

七、病毒攻擊方式

1. 病毒感染植物可區分為subliminal infection、local infection與systemic infection，請說明三者有何不同。(6分台大106)
2. 請說明植物病毒如何由最初感染的細胞擴展至整株植物?是否需要特殊的病毒蛋白協助，已完成系統性感染?(7分台大103)
3. 植物病毒可經由那些方式傳播?(5分台大103)
4. 比較試說明differential host plant與indicator plant。(6分台大99)

八、病毒媒介

1. 比較非永續性與永續性媒介昆蟲傳播的植物病毒性病害，何者較難防治，試說明其原因。(6分台大104)
2. Potyvirus的HC-Pro基因產物在蚜蟲傳播的過程中扮演什麼角色，其作用機制為何? (3分中興107)
3. 那一屬植物病毒可經由薊馬傳播?(2分台大99)
4. 那幾屬植物病毒可以經由線蟲傳播?又這些植物病毒屬分別經由那些屬線蟲傳播?(5分中興10)
5. 那幾屬植物病毒可經由線蟲傳播?那幾屬真菌可傳播植物病毒?(5分台大98)
6. 請分別寫出下列植物病毒屬之主要傳播媒介生物:Cucumovirus、Nepovirus、Tospovirus、Potyvirus和Begomovirus。(5分台大105)

九、病毒防治

1. 舉例並說明四種利用PTGS(post-transcriptional gene silencing)機制來產生抗多種植物病毒病害(multiple vius resistance)之轉基因策略。(8分中興103)
2. 植物病毒為何能引起植物的PTGS(post transcriptional gene silencing)，試說明原因。病毒是否有對抗PIGS的方法?(6分台大100)
3. RNA病毒為何能引起植物的PTGS(post transcriptional gene silencing)，試說明原因。(6分台大98)
4. 植物如何對抗入侵細胞內的病毒?病毒是否有反制植物的方法?請說明這兩種現象。(6分台大102)

十、病毒各論

1. 請說明Geminiviridae科病毒的顆粒型態、核酸性質及各屬的傳播媒介。(6分中興103)
2. 試述Geminiviridae科病毒的顆粒型態與核酸性質，並繪圖說明該科病毒之複製方式。(7分台大100)
3. 試述Reoviridae科病毒的顆粒型態與核酸性質，並繪圖說明該科病毒之複製方式。(6分台大102)
4. 試述Caulimoviridae科病毒的核酸性質，並繪圖說明該科病毒之複製和基因表現方式。(6分台大101)
5. 類病毒(viroid)可分為Pospiviroidae與Avsunviroidae兩科，請比較兩者之差異並寫出這兩科的代表種(type species)學名。(10分中興104)
6. 請說明Begomovirus屬病毒之粒子型態、核酸特性及傳播途徑，並繪圖說明該屬病毒之複製方式。(10分中興101)
7. 請敘述下列植物病毒屬之顆粒型態、基因表現策略及傳播特性。(16分中興100)

1. Tobamovirus

2. Begomovirus

3. Potyvirus

4. Tospovirus

8. 請說明下列植物病毒之基因體組成、傳播特性(vecor)及其分類地位所屬之屬名(genus)。(15分中興104)

1. Grapevine fanleaf virus

2. Tobacco necrosis virus A

3. Maize chlorotic mottle virus

4. Tomato yellow leaf curl Thailand virus

5. Banana bunchy top virus

9. 請說明下列植物病毒之核酸性質、傳播媒介(vector)及其分類地位所屬之屬名(genus)。(9分中興103)

1. Capsicum chlorosis virus

2. Rice yellow stunt virus

3. Cauliflower mosaic virus

10. 請說明下列植物病毒之基因體組成、傳播特性及其分類地位所屬之英文屬名(genus)。(12分中興102)

1. Banana bunchy top virus

2. Tomato yellow leaf curl virus

3. Tomato spotted wilt virus

4. Rice ragged stunt virus

11. 試說明引起菸草嵌紋病(tobacco mosaic disease)之病毒學名、顆粒型態、核酸特性、傳播方式與防治策略。(9分台大107)
12. 試說明引起香蕉萎縮病(banana bunchy top disease)之病毒其顆粒型態、核酸特性、傳播方法與防治策略。(8分台大105)

十一、解釋名詞

1. 請說明Heteroencasidation和Phenotypic mixing(3分中興107)
2. 請說明pathogen-derived resistance(3分中興107)
3. 何謂synergism?以PVY及PVX為例說明哪一個病毒的複製明顯增加許多?哪一個病毒的哪一個基因促成這樣的結果?(6分中興105)
4. 何謂synergistic effect?以PVY及PVX為例說明哪一個病毒的複製明顯增加很多?哪一個病毒的哪一個基因促成這樣的結果?(6分中興102)
5. 請解釋下列名詞(7分中興102)

1. co-translational disassembly and co-replicational disassembly

2. heteroencasidation and phenotypic mixing

3. transcriptional gene silencing and post-transcriptional gene silencing

4. double antibody sandwich-ELISA

6. 解釋與比較下列名詞：(8分中興101)

1. Heteroencasidation versus phenotypic mixing

2. Defective interfering (DI) nucleic acids versus defective (D) viruses

3. Tm-1 gene versus Tm-2² gene (in tomato)

4. Pospiviroids和Avsumviroids的RNA增殖機制

7. 請解釋下列名詞：(10分中興100)

1.satellite virus and satellite nucleic acid

2.direct-ELISA and indirect-ELISA

3.reverse genetics and forward genetics

4. bacteriocin and antibiotics

5. pathogenicity genes and virulence genes